Die Immatrikulation an der MU-Varna kann nur nach der Zahlung der entsprechenden Semestergebühr erfolgen. Diese ist i.d.R. zwei Wochen vor oder zwei Wochen nach Semesterbeginn zu zahlen. Ein Zahlungsnachweis auf Papier muss dem Deans Office vorgelegt werden. Die Fristen können jedes Semester variieren und werden immer online bekanntgemacht, sollte dies nicht der Fall sein, gilt diе o.g. Zweiwochenfrist.
Ein Lastschriftverfahren für die Semestergebühren ist in Bulgarien nicht möglich. Diese müssen jedes Semester physisch aus einem aus- oder inländischen Konto der MU-Varna überwiesen werden.