В Катедрата по микробиология и вирусология се провеждат лекционен курс и практически занятия на студентите от специалности „Медицина", „Дентална медицина", „Фармация", „Акушерка" и „Медицинска сестра". През настоящата учебна 2013-2014 година стартира обучение по специалностите „Акушерка" и „Медицинска сестра", посредством конферентна връзка във Филиал Сливен.
Последователно бе въведено англоезично обучение на студенти по медицина и дентална медицина. От 2012 г. преподавателите поеха лекционния курс на студентите от Медицински колеж, обучаващи се в специалности „Медицински лаборант", „Инспектор по обществено здраве", „Помощник-фармацевт", „Медицинска козметика".
Въведени са семестриален текущ контрол, колоквиуми и входящ тест за допускане до изпит. Основен принцип в преподаването на студентите е непрекъснатото обновяване на преподавания материал с въвеждане на нови форми и поддържане на знания на съвременно ниво както за лекционния курс, така и за практическите занятия. Функционира система за приемственост и уеднаквяване на преподаването.
Катедрата организира обучение в свободно избираема дисциплина (СИД) „Клинична микробиология" за студентите от специалност „Медицина", където се предлага най-нова съвременна информация за ролята на инфекциозните агенти в човешката патология. Студентите подготвят реферати по избрана от тях тема и правят презентации – стъпка към обучение за презентация на научна разработка.
Преподавателите от катедрата са автори и съавтори на следните учебни помагала:
- Клинична вирусология. Под редакцията на С. Дундаров, Д. Дундарова, Р. Аргирова, В. Русев. (С участието на доц. д-р Л. Иванова) София, 2006.
- Medical microbiology. Training guide for students in Medical universities. T. Stoeva, Varna, 2011.
- Учебник по микробиология. К. Божкова.
В лекционния курс участват и проф. д-р Красимир Методиев, д-р Виолина Калудова и биолог Габриела Цанкова от Катедрата по предклинични и клинични науки към Факултет по фармация, МУ-Варна.