Университетските бази за обучение на студентите от МУ-Варна предоставят възможност за високо качество на клиничното и предклинично обучение на студентите от медицинските специалности. Университетът разполага с модерни високотехнологични диагностични звена, оборудвани с конвенционална и с уникална апаратура за практическо обучение както на студенти, така и на докторанти и специализанти. В Университетската многопрофилна болница за активно лечение „Св. Марина”, Многопрофилната болница за активно лечение „Св. Анна”, Специализираната болница по акушерство и гинекология „Проф. Д. Стаматов” – Варна, Университетската специализирана болница по очни болести за активно лечение – Варна, Многопрофилна болница за активно лечение – Варна към Военномедицинска академия, Факултет по дентална медицина, Университетски медико-дентален център, Университетски център по източна медицина, Аптеки Медунифарм, Регионална здравна инспекция – Варна и Медицински колеж – Варна се осъществява обучение по клиничните медицински дисциплини.
